Обелиски не похожи ни на один другой биологический агент и они были найдены по всему миру.
Изучая многочисленные микробы, колонизировавшие человеческое тело, команда исследователей наткнулась на нечто странное: ранее непризнанный класс вирусоподобных объектов, которые ученые окрестили “обелисками”. Предполагается, что эти недавно описанные организмы обитают в ротовой полости и кишечных бактериях человека и имеют геномы с кольцевой РНК, последовательности которой были найдены по всему миру.
Исследователи обнаружили почти 30 000 различных обелисков, причем на всех континентах, изучив более 5 миллионов наборов данных, содержащих опубликованные генетические последовательности.
“Это безумие”, – сказал Марк Пейфер, биолог, изучающий клетки и развитие в Университете Северной Каролины в Чапел-Хилл. “Чем больше мы смотрим, тем больше странных вещей мы находим”.
В работе, которая еще не прошла рецензирование, обелиски были обнаружены в 7 процентах проанализированных образцов стула и в 50 процентах образцов ротовой полости. Кроме того, было определено, что их последовательности отличаются в зависимости от того, где именно они были найдены в организме.
Они не имеют структурного сходства с известными биологическими агентами, поэтому “представляют собой класс разнообразных РНК, которые колонизировали и остались незамеченными в микробиомах человека и всего мира”, – пишут авторы в своем препринте.
Обелиски названы в честь стержнеподобных структур, которые, как предполагается, охватывают весь их геном и напоминают одноименный монумент.
Геномы вирусоподобных образований имеют длину всего 1 000 оснований, что, вероятно, отличает их от РНК-вирусов, у которых обычно гораздо более длинные последовательности.
Обелиски также включают гены, кодирующие новое суперсемейство белков под названием “oblins”, которые, как предполагают исследователи, могут быть вовлечены в репликацию РНК. Это отличает их от более простых РНК-петель, называемых вироидами, которые не кодируют белки.
Таким образом, обелиски похожи на вирусы, но это не вирусы, и не вироиды. Они могут даже не вести себя так же, как вирусы: “Эти элементы могут даже не быть “вирусными” по своей природе”, – объясняют исследователи, поскольку в настоящее время “невозможно определить способ передачи, воздействие на хозяина или способ репликации”. Вместо этого они могут больше походить на РНК-плазмиды, заключает команда.
Из-за этих неизвестных факторов влияние обелисков на здоровье человека также остается под вопросом.
Тем не менее, полученные результаты помогают уточнить то, что мы знаем об эволюции вирусов, которая до сих пор окутана множеством тайн. “Это одна из самых захватывающих сторон работы в этой области”, – сказал Саймон Ру из Объединенного института генома Министерства энергетики в Национальной лаборатории Лоуренса Беркли. “Мы видим сегодня, как постепенно вырисовывается картина долгосрочной эволюции вирусов на Земле”.
Исследование, не прошедшее рецензирование, доступно на сайте bioRxiv.
Читайте также: В Марианской впадине обнаружен самый глубоководный из когда-либо найденных вирусов