Мы не многое знаем об ERV-Fc, но известно, что он был очень распространенным.
Между 33 и 15 миллионами лет назад группа древних вирусов заразила бесчисленных древних млекопитающих, включая предков всего, от людей и шимпанзе до земляных свинок и панд. Эта группа доисторических вирусов в конечном итоге вымерла около 15 миллионов лет назад – возможно, может быть потому, что она заразила всех хозяев, которых могла, – но неактивные фрагменты ее ДНК все еще тайно живут во многих современных млекопитающих (включая нас).
Это странная мысль, но до 8 процентов нашего генома состоит из генетических последовательностей ретровирусов, которые заражали наших предков давным-давно.
Любые ретровирусы, включая современные, такие как ВИЧ, должны вставлять копию своего РНК-генома в ДНК клетки-хозяина для репликации. Этот вирусный генетический материал обычно не передается из поколения в поколение, но может передаваться, если древние ретровирусы приобрели способность заражать зародышевые клетки, такие как яйцеклетка или сперматозоид, которые действительно передают свою ДНК будущим поколениям.
Если ретровирусы успешно попадают в зародышевые клетки, они в конечном итоге могут быть встроены в геном популяции. Это известно как эндогенный ретровирус.
Возможно, одним из самых успешных примеров является ERV-Fc, ретровирус (или, может быть, род или семейство ретровирусов), который распространился по всему миру от олигоцена до раннего миоцена (между 30 и 15 миллионами лет назад).
В 2016 году ученые просканировали геномы 50 современных млекопитающих на наличие “ископаемых” вирусных останков ERV-Fc и обнаружили, что он присутствовал у предков по крайней мере 28 из них, включая родственников трубкозуба, серого мышиного лемура, беличьей обезьяны, мартышки, павиана, шимпанзе, человека, собаки и панды.
Еще более впечатляющим является то, что он заразил не одного предка всех этих млекопитающих один-единственный раз, а перепрыгивал между видами более 20 раз. Это была поистине межконтинентальная пандемия, затронувшая млекопитающих на каждом континенте, кроме относительно изолированных регионов Австралии и Антарктиды.
Похоже, что ERV-Fc сегодня не оказывает никакого влияния на здоровье человека; фрагмент его генетического материала просто бездействует в нашем геноме. Однако более глубокое понимание ERV-Fc и других эндогенных ретровирусов человека может помочь в подходе к современным заболеваниям, таким как ВИЧ.
“В геномах млекопитающих содержатся сотни тысяч древних вирусных “окаменелостей”, подобных ERV-Fc”, – сказал Уильям Э. Диль, главный автор исследования 2016 года, проведенного им во время работы в качестве постдока в Бостонском колледже.
“А сегодня задача состоит в том, чтобы использовать древние вирусные последовательности для того, чтобы оглянуться назад во времени, что может оказаться полезным при прогнозировании долгосрочных последствий вновь возникающих вирусных инфекций. Например, мы потенциально могли бы оценить влияние того же ВИЧ на здоровье человека через 30 миллионов лет. Этот метод позволит нам лучше понять, когда и почему возникают новые вирусы, и как долгосрочный контакт с ними влияет на эволюцию организмов-хозяев”, – пояснил Диль.
Читайте также: Обелиски: новый класс вирусоподобных объектов обнаружен в микробах кишечника человека